对于生殖器疱疹的诊断应该根据病史、临床典型表现作出，另外在结核下列实验室检查中的其中一项即可确诊生殖器疱疹病情：

1.核酸检测：通过聚合酶链反应(PCR)等方法检测HSV-2核酸。已有报道应用核酸杂交技术及PCR技术诊断生殖器疱疹，可提高诊断的敏感性并可进行分型。

2.检测病毒抗原：从皮损处取标本，以单克隆抗体直接荧光法或酶联免疫吸附法(ELISA)检测单纯疱疹病毒抗原，病毒抗原检测是临床常用的快速诊断方法。

3.细胞学检查(Tzanck涂片)：以玻片在疱底作印片，Wright染色或Giemsa染色，显微镜下可见到具特征性的多核巨细胞或核内病毒包涵体，此法敏感性低。

4.病毒培养：从皮损处取标本作病毒培养，发现有单纯疱疹病毒和细胞病变。另外成都生殖专科医院生殖器疱疹专家表示：取皮损处标本进行病毒培养、分离、鉴定、分型，是诊断HSV感染的金标准方法，但操作复杂，花费大。